资讯 | 兰州大学团队研发出绵羊基因组育种芯片并产业化应用

近日，兰州大学草地农业科技学院反刍动物研究所王维民教授团队发布了国内首款基于大规模基因组选择参考群的高性能绵羊基因组育种芯片“兰大·华羊芯”，这是该团队组织实施的“绵羊双万羊基因组计划”的第一阶段重大成果。

近年来，基因组育种技术在动植物育种中得到广泛应用，加速了全球农用动物的遗传改良。我国在羊基因组育种方面落后于国外，也落后于国内猪、禽、牛等畜种，主要是没有建立起覆盖重要经济性状的大规模参考群和遗传评估技术体系。为改变我国绵羊基因组育种技术落后的局面，在王维民教授和乐祥鹏教授组织下，至今历时9年，累计投入23.5万人时，通过持续精准的大规模性能测定与基因组重测序，率先在国内构建规模达10318只、羊只来源覆盖全国8家国家湖羊核心育种场和4家规模化湖羊种羊场的基因组选择参考群，累计获得了80万条表型数据和78Tb基因组数据，绘制出包含2000万个高质量遗传变异位点超高分辨率的湖羊基因组遗传变异图谱，鉴定出饲料转化率、生长速度、尾脂重、肌内脂肪等一系列重要经济性状关键基因。以此为基础，兰州大学王维民教授团队联合石家庄博瑞迪生物技术有限公司，利用大数据、生物信息学、育种学等技术，研发出包含45052个具有代表性、全局性、功能性SNPs位点的高性能45K基因组育种芯片“兰大·华羊芯”，并衍生出适于不同应用场景灵活使用的10K低密度和1K超低密度两款配套使用的系列育种芯片。在45052个芯片位点中囊括了自主鉴定的体重、生长速度、饲料转化率、尾脂重、肌肉品质、肋骨数等重要经济性状的大效应关联位点3177个。“兰大·华羊芯”配套相应的遗传评估技术，可用于湖羊基因组选择育种、重要经济性状基因定位、品种鉴定、家系划分、系谱校正等。

“兰大·华羊芯”设计和遗传评估技术经业内专家反复论证，并在天津奥群牧业有限公司、甘肃润牧生物工程有限公司、甘肃羊如祥农业有限公司和金昌居佳生态农业有限公司等有关企业进行了近万只羊的验证，其在重要经济性状的选种准确性上已经可以比肩国际同行，我国绵羊育种中最具潜力的突破性性状饲料转化率的基因组预测填补了全球绵羊基因组选择育种的空白，目前市场订单达6.9万张，预计每年应用10万张以上，市场前景十分广阔。（来源：兰州大学）