多年来，公司获得国家、省、市级多项殊荣，是国家高新技术企业、云南省科技型中小企业、昆明企业联合会昆明企业家协会理事单位、昆明工业经济联合会常务理事单位、 云南省成长型中小企业、第三届中国创新创业大赛优秀企业、中国创客大赛一等奖、集团总经理马明星博士荣获“中国侨界贡献奖”一等奖。
2021年，评选为“云南省省级专精特新‘成长’企业”（2022.2~2025.1）
2022年3月，寰基生物被云南省工业和信息化厅联合省发展改革委、省农业农村厅、省商务厅评选为“云南省产业互联网创新服务主体”，持续助推"数字云南"建设工作。
2023年5月，被云南省工信厅授予“专精特新”中小企业称号（2023年5月6日~2026年5月5日）。
获得国家、省、市级多项殊荣：
2014年，第三届中国创新创业大赛优秀企业
2015年，入围第四届中国创新创业大赛企业组行业总决赛
2016年，获得首届春城创业荟项目类三等奖
2017年，“用基因检测带动精准医疗”项目在第六届中国创新创业大赛云南赛区暨第三届云南省创新创业大赛中荣获企业成长组三等奖
2015年，与吉林大学基础医学院构建产学研合作基地，并进行长期的合作研究
2019年，与解放军联勤保障部队九二〇医院联合申报的“临床感染性病原微生物检测新策略构建与应用”项目，获得云南省科技进步二等奖
云南省科学技术进步二等奖
寰基集团昆明寰基生物芯片产业有限公司目前拥有生物芯片技术研发中心，生物芯片诊断产品产业化中心。基因芯片研发中心拥有基因芯片生物学研究和生物芯片开发的全套硬件条件，由海归博士带领的研究团队，先后完成了满足多种检测需求的基因芯片检测技术，达到国内领先水平。目前，集团拥有有效专利共计25项，其中，发明专利6项，实用新型专利共14项，软件著作共6项。公司前期研发的产品荣获国家第十八届发明博览会金奖。
2021年1月，寰基集团董事长滕仕喜被评为全国抗疫先进个人
集团总经理马明星博士荣获“中国侨界贡献奖”一等奖
