前沿 | 八倍体中华鲟全基因组测序组装完成

2023-09-12 09:09:40 5

中国三峡集团生态工程中心长江生物多样性研究中心日前发布消息称,研究中心团队历经十年艰苦努力和探索,成功完成中华鲟的全基因组测序组装。

随着野生中华鲟规模持续下降,人工保种和增殖放流对于中华鲟保护更加重要。2013年中华鲟自然繁殖中断,亟需加快新的保护技术研发助力中华鲟保护。中华鲟种质纯度鉴定、早期性别鉴定、遗传多样性评估和管理、疾病防治和遗传发育等诸多保护理论和技术的研究都离不开基因组信息做支撑。

全基因序列图谱是生命的字典,是物种基因的北斗导航图,是很多生命科学理论和技术研究的底层技术。据三峡集团中华鲟物种保护专家杜合军介绍,中华鲟是多倍体,基因组包含264条染色体,染色体数量是人类的5-6倍,且一半的染色体是微型染色体。“这么复杂的基因组在动物中很少见。可以说,中华鲟全基因组测序之后的组装难度堪比基因组研究领域的‘三峡工程’”。

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中华鲟和人类染色体组成比较。A:中华鲟染色体组成;B:人类男性染色体组成。

(三峡集团生态工程中心长江生物多样性研究中心供图)

从2013年起,研究团队经过多年探索,先后突破了中华鲟雌核发育技术、开发了中华鲟早期性别内窥镜鉴定技术。杜合军说,团队研究成果为中华鲟繁育、种质保护和种群建设管理等研究提供了首个参考基因组,解决了长期以来制约中华鲟种质鉴定技术开发、性别标记开发、繁育和生长机理等保护理论和技术研究快速推进的难题。研究团队还从基因组角度,揭示了中华鲟为同源八倍体及其形成过程。

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中华鲟基因组组装序列图谱关键特征分布图

(三峡集团生态工程中心长江生物多样性研究中心供图)

生物多样性研究中心相关负责人姜伟表示,该研究成果为中华鲟等鲟鱼类的种质资源保护、遗传育种和增殖放流等保护技术研究提供了基本的基因组参考信息,将会带动中华鲟等鲟鱼的保护技术研究向更深和更广的领域快速发展。(来源:新华社)